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研究人員發現：血統與數百個基因的同種變異有關，但一些最重要的癌癥變異發生在特定類型的組織中。這一研究結果發表在《癌細胞》（Cancer Cell）雜志。差異

文章來源 | 丹娜法伯癌癥研究院

翻譯 | 陳振翀

審校 | 巢栩嘉

雖然2003年已完成了人類基因組測序（HGP），同種但在癌癥研究中，癌癥有關腫瘤中的差異譜系印記等問題仍懸而未決。非洲后裔和歐洲后裔所患的同種肝癌存在基礎的、分子水平的癌癥差異？東亞人與印第安人患的乳腺癌在基因圖譜上有區別嗎?

由美國癌癥研究院癌癥基因組分析網絡（NCI Cancer Genome Analysis Network）的研究人員發表了一篇新論文，提供了目前最全面的差異血統對正常或癌變組織分子組成的影響。研究人員根據包含10678名患者和33種癌癥類型的同種癌癥基因組圖譜（TCGA）數據，發現血統與數百個基因的癌癥變異有關，但一些最重要的差異變異發生在特定類型的組織中。這一研究結果發表在《癌細胞》（Cancer Cell）雜志。同種

丹娜法伯與布羅德研究所的癌癥醫學和哲學博士Rameen Beroukhim是這一研究的共同通訊作者之一。他說：“我們發現在不同血統的差異癌癥患者中，這些分子特性差異很大程度上存在于特定類型的器官和組織中。這表明無論是在正常組織還是癌變組織中，追蹤血統對分子的影響，都需要逐一檢測各個組織。”

從分子的角度來看，非洲血統的人往往與歐洲血統的人所患的腎癌類型，并不相同。在非洲血統的人體內，較少出現VHL基因的失活突變，這一基因突變會加快腫瘤中的新血管生長。而與歐洲血統的人相比，東亞血統的人患膀胱癌時，體內產生的免疫系統反應更少。

在這項研究里，研究人員使用多種分子技術分析不同血統的患者的組織樣本。患者被主要分成：歐洲人、非洲人、東亞人、南亞人、印第安人或拉美人。另外，他們將至少具有20%混合血統的患者歸入混血類別（根據主要血統被分為亞類，比如非洲混血，歐洲混血等）。整個研究中，患者共有33種癌癥類型，其中13種被進一步分為亞型。

通過癌癥基因組圖譜（TCGA），他們對每個患者的組織進行了深入分析，檢測了癌細胞和正常細胞中的一系列分子特征。這些特征包括基因突變（DNA復制錯誤）、DNA甲基化模式（影響基因的表達）、信使RNA（DNA的轉錄模版）和microRNA（可協助或抑制基因的表達）。NCI癌癥基因組分析網絡的研究人員通過這些數據來觀察，這些特征的差異是否反映了血統的差異。

Cherniack說：“我們發現，和血統相關的所有分子特征差異，存在于數百個不同的基因中。然而，結果表明，那些最顯著的差異，即能夠影響細胞的功能及其與其他身體部位的相互作用，具有明顯的組織特異性。”盡管，在大多數類型的癌癥中，血統會影響到的分子特征，但不會同時影響多種癌癥。例如，和非洲血統相關的肺癌中的分子差異，并不存在于乳腺癌、胰腺癌等癌癥中。

這些數據也使研究人員想問，當正常細胞演變成癌細胞是，它們攜帶的、和血統相關的特性是否被帶進了癌細胞中。比如，歐洲血統的人的肺細胞分子特征，是否也能在他們的肺癌細胞中找到？研究人員發現，絕大多數情況都是這樣。Beroukhim說，“在特定血統的人身上，正常組織的大多數分子差異都會出現在癌細胞中。”此外，有證據表明，其中一些分子差異可能會使擁有相似背景的人，患上特定的癌癥。

研究人員表示，由混血患者提供的數據十分寶貴。在初步分析擁有至少80%的5個譜系血統的患者后，他們對來自混血人群的數據，進行類似的分析。文章共同作者之一、丹娜·法伯與布羅德研究所Meyerson研究團隊的博士后Jian Carrot-Zhang說：“我們發現兩組鑒定的結果一致，即某一血統特有的分子差異，也會出現在擁有這一血統的混血患者身上。這一結果，強有力地支撐了我們最初的發現，” Beroukhim說：“在研究血統在癌癥中的分子效應時，混血背景的患者是一個特別強大的群體。它能幫助我們縮小導致這些差異的基因組范圍。”

研究人員尚未確定血統間的分子差異，是由環境因素還是遺傳因素造成的。然而，他們的確發現了血統之間的遺傳差異，這可解釋在癌癥中的許多發現。Beroukhim說：“我們的研究也指出，需要更多的血統樣本來開展一個更加全面的血統分析，尤其針對于正常組織。這項研究也朝這一方向邁出重要的一步。”

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//medicalxpress.com/news/2020-05-ancestry-molecular-makeup-cancer.html