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發布日期:2024-01-05


清華大學的創造出鏡研究人員制造了一種蛋白的鏡像形式,可以行使兩個最基本生命功能:復制 DNA 并將其轉錄為 RNA。鏡中

創造鏡中世界,用鏡像酶制造出鏡像DNA

 

創造鏡中世界,用鏡像酶制造出鏡像DNA

來自麻哈佛醫學院(Harvard Medical School)的世界分子生物學家 Jack Szostak 認為,這項工作使得制造鏡像生命形態前進了“一小步”。用鏡他的像酶像哈佛同事 George Church 補充道,“這是制造一個了不起的里程碑。”Church 希望有一天能夠制造出完全的創造出鏡鏡像細胞。

創造鏡中世界,用鏡像酶制造出鏡像DNA

 

許多有機分子具有“手性”:它們以鏡像方式存在,鏡中而不能重疊,世界正如右手與左手的用鏡手套。但生命幾乎總是像酶像利用一種形式:比如,細胞使用左手型的制造氨基酸,而 DNA 呈右手螺旋卷曲。創造出鏡

 

理論上,鏡中這些分子的世界鏡像形式應當與常見形式一樣,具有相同的功能,但它們可能對常規病毒及非鏡像世界的酶具有抗性。

 

這就使鏡像生物化學成了潛在的高利潤行業。柏林的 Noxxon 制藥公司就是這樣期望的。它利用實驗室化學合成方法制造短鏈 DNA 或 RNA 的鏡像形式,稱為(核酸)適體(aptamers),能夠結合到體內蛋白等治療靶點,阻斷其活性。該公司擁有若干種針對人類臨床疾病(包括癌癥)的候選鏡像適體;因為它們并不能被人體的酶降解,效力還可能提升。復制鏡像 DNA 的過程能夠提供更簡單的辦法來制造核酸適體,Noxxon 制藥公司的首席科學家 Sven Klussmann說。

 

穿越鏡子

 

研究人員花費了數十年制造大量的鏡像 DNA,所以清華團隊能夠從化學供應商那里訂購到復制鏡像 DNA 所需的大部分原料:待復制的鏡像 DNA 鏈,組成鏡像 DNA 的小分子,以及能夠以正確順序添加小分子的鏡像“引物”鏈。

 

困難的是制造出協調該復制過程的叫做 DNA  聚合酶(DNA polymerase)的鏡像酶。這需要從右手型氨基酸開始合成,但常用的聚合酶含有六百多個氨基酸——意味著對當前的合成方法來說它們數量過大。

 

所以清華團隊轉向了已知最小的聚合酶:非洲豬瘟病毒聚合酶 X,它僅含 174個氨基酸。不幸的是,它的合成速度非常慢——大概是因為它太小,合成生物學家 Ting Zhu 說道,他是 Szostak 之前的學生,幫助指導這項工作。該團隊制造了這個聚合酶的鏡像版本并發現,同它的自然構型酶類似,它能夠在約 4 小時內,將含有 12 個核苷酸(構成 DNA 的小分子)的鏡像引物延伸成 18 個核苷酸的鏡像 DNA 鏈;在 36 小時內將其延伸至 56 個核苷酸。

 

當把這些系統的常見形態與鏡像形態混合在同一個試管中時,兩種復制過程獨立進行、互不干擾。鏡像聚合酶也能夠將鏡像 DNA 轉錄為鏡像 RNA,仍然非常慢。此項工作發表于 Nature Chemistry。

 

Klussmann 表示,Noxxon 制藥對用更高效的酶來進行此類合成的方法非常感興趣。事實上,Zhu 與其同事接下來希望制造出更高效的聚合酶 Dpo4 的鏡像形式,該酶由 352 個氨基酸構成。

 

反方向的生命

 

在論文中,清華的研究人員還試圖探討為何生命的手性呈現現在這樣。這仍然神秘:可能僅僅是出于偶然,也可能由自然中基本的不對稱所觸發。

 

佛羅里達州阿拉華應用分子進化基金會(Foundation for Applied Molecular Evolution in Alachua)的 Steven Benner 表示,生化上制造出生命的鏡像形式不太可能對解決這個問題有什么啟發。以鏡像方式看,幾乎每個物理過程都相同。唯一已知的例外——稱為“宇稱不守恒”(parityviolations)——存在于亞原子物理的世界。Benner 認為這些細微的差別不能在生化實驗中表現出來。(他也對制造出能夠不被天然酶和病毒隨意降解的 DNA 感興趣,但并非使用鏡像 DNA,他使用非天然小分子合成了人工 DNA。) 

 

Church 的最終目標——制造全鏡像細胞,面臨著巨大的挑戰。自然界中,RNA被復雜的分子機器——核糖體翻譯成蛋白質。Zhu表示,“重構核糖體的鏡像形式這個認為任務將令人望而生畏的”。因此,Church 正試著讓正常核糖體突變,使它能夠處理鏡像 RNA。

 

Church 表示,誰也說不準哪種方式可能會成功。他提到越來越多的研究人員在作關于生化過程的鏡像形式的工作。“這一領域曾經很少有人關注”,Church 說,“但現在非常活躍。”


作者 Mark Peplow

翻譯 趙琳

審校 譚坤


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